Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Fndc1E9Q043 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc1E9Q043 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms