Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Tspan4Q9DCK3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tspan4Q9DCK3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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