Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg4aQ8C9S8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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