Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms