Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Phox2aQ62066 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Phox2aQ62066 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Phox2aQ62066 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Phox2aQ62066 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Phox2aQ62066 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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