Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trp53i11Q4QQM4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trp53i11Q4QQM4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trp53i11Q4QQM4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trp53i11Q4QQM4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trp53i11Q4QQM4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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