Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp48Q3V0C5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp48Q3V0C5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp48Q3V0C5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp48Q3V0C5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp48Q3V0C5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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