Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc13Q3TIR1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms