Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Col24a1Q30D77 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms