Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EEA1Q15075 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms