Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spatc1Q148B6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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