Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Emx2Q04744 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms