Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Scn1bP97952 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Scn1bP97952 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms