Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gfra1P97785 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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