Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LtbP41155 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LtbP41155 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LtbP41155 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms