Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GGCXP38435 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GGCXP38435 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GGCXP38435 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GGCXP38435 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms