Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lamp1P11438 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp1P11438 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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