Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm9602J3QPD5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm9602J3QPD5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms