Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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