Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms