Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn7Q9Z261 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn7Q9Z261 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn7Q9Z261 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms