Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddx39bQ9Z1N5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms