Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne6Q9Z140 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne6Q9Z140 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne6Q9Z140 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms