Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ClcnkbQ9WUB6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ClcnkbQ9WUB6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms