Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psma1Q9R1P4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psma1Q9R1P4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms