Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmb3Q9R1P1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmb3Q9R1P1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms