Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Phtf1Q9QZ09 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phtf1Q9QZ09 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phtf1Q9QZ09 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms