Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VapbQ9QY76 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VapbQ9QY76 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms