Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snai3Q9QY31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snai3Q9QY31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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