Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pex3Q9QXY9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex3Q9QXY9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 393.6 ms