Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Kcnip3Q9QXT8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnip3Q9QXT8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms