Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trip4Q9QXN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trip4Q9QXN3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip4Q9QXN3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms