Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Homer2Q9QWW1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Homer2Q9QWW1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Homer2Q9QWW1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.6 ms