Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.13■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MBD5Q9P267 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MBD5Q9P267 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
MBD5Q9P267 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms