Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPD4Q9NXE4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms