Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn15Q9JLG8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn15Q9JLG8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn15Q9JLG8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms