Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr5Q9JLF7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr5Q9JLF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr5Q9JLF7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr5Q9JLF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms