Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scamp4Q9JKV5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms