Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf3Q9JKL4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms