Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms