Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Tuba8Q9JJZ2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tuba8Q9JJZ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tuba8Q9JJZ2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tuba8Q9JJZ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tuba8Q9JJZ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tuba8Q9JJZ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tuba8Q9JJZ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms