Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PigbQ9JJQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PigbQ9JJQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PigbQ9JJQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms