Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prmt1Q9JIF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prmt1Q9JIF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prmt1Q9JIF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms