Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pus3Q9JI38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pus3Q9JI38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms