Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Copz2Q9JHH9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Copz2Q9JHH9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms