Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn12Q9ET43 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn12Q9ET43 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms