Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem27Q9ESG4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem27Q9ESG4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms