Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nek6Q9ES70 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nek6Q9ES70 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms