Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk4Q9ERK0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ripk4Q9ERK0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ripk4Q9ERK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms