Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Clstn2Q9ER65 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Clstn2Q9ER65 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms